Introduction

Korean Gut Microbiome Bank (KGMB) 프로젝트는 건강한 한국인의 장내 마이크로바이옴 메타게놈 분석을 기반으로, 생애주기별 주요 장내미생물들을 정의하고, 절대혐기성 미생물을 포함한 주요 장내 미생물들의 분리와 배양 최적화 기술 개발을 통해 세계 최고 수준의 마이크로바이옴 자원 뱅크 및 통합 정보 시스템을 구축함으로써 마이크로바이옴 자원 활용 및 실용화를 지원하고자 한다.

The purpose of the KGMB project is to define the major gut microbiome by life cycle based on the metagenome analysis of the gut microbiome of healthy Koreans, develop a technology for isolating and culturing major gut microbes, including obligate anaerobic microorganisms, and build world-class microbiome resource bank and an integrated information system. We hope to accelerate the various utilization and commercialization of microbiome resources. Through this, we intend to support the utilization and commercialization of microbiome resources.

  • 건강한 한국인의 기준 정립 및 임상샘플 확보
    • 의학적 개념의 건강인 기준 확립
    • 최적의 분변 샘플 수집 프로토콜 구축
    • 생애주기별 주요 장내미생물 분석과 분리를 위한 분변 및 메타데이터 수집
  • 임상정보와 연계된 장내 마이크로바이옴 메타게놈 분석
    • 다양한 NGS 장비 platform에서 생산되는 데이터의 표준 생물정보 분석 파이프라인 구축
    • Metagenome/metatranscriptome 분석을 위한 시료 전처리 및 핵산추출법 표준화
    • 유용 절대혐기성 미생물을 대상으로 하는 유전체 및 비교유전체 데이터 분석
    • 생산된 장내 마이크로바이옴 군집(community), 메타유전체, 메타전사체 데이터 등을 종합적으로 분석하는 통합시스템 구축 및 최적화
  • 메타게놈 분석기반 세계 최고 수준의 장내 마이크로바이옴 자원 뱅크 구축
    • 절대혐기성 미생물을 포함한 주요 장내미생물 분리 기술 개발
    • 장내 절대혐기성 미생물 배양 기술 개발 및 프로토콜 표준화
    • 마이크로바이옴 자원 특성별 최적화된 보존 기술 확립
  • 건강한 한국인의 장내 마이크로바이옴 자원 통합 DB 및 운영시스템 구축
    • 국제적 표준에 적합한 한국인의 장내 마이크로바이옴 자원 DB 구축(KGMB 인프라넷)
    • 메타게놈, 멀티오믹스 분석 및 실물자원과 연계된 통합 DB 구축 및 활용 지원
  • 장내 마이크로바이옴 연구 활성화 및 실용화 지원
    • 유용 장내미생물의 멀티오믹스 분석 지원을 통한 연구 활성화
    • 장내 마이크로바이옴 자원 기시법 개발 및 자원 분양을 통한 임상활용 및 산업화 지원
    • 장내 절대혐기성 미생물 배양 및 보존기술 교육을 위한 워크숍 개최
    • 마이크로바이옴 자원 및 관련 기술의 기술 이전 지원
  • Establishment criteria of healthy Korean and securing clinical samples
    • Establishment of medically healthy criteria
    • Establishing an optimal fecal sample collection protocol
    • Collection of feces and metadata for analysis and isolation of gut microbes by life cycle
  • Korean gut microbiome metagenome analysis linked to clinical information
    • Establishment of standard bioinformatic analysis pipeline of data produced by various NGS equipment platforms (Illumina, Pacbio, etc.)
    • Standardization of sample preparation and nucleic acid extraction methods for metagenome/metatranscriptome analysis
    • Analysis of genomic and comparative genomic data of useful obligate anaerobic microorganisms
    • Establishment and optimization of an integrated system that comprehensively analyzes gut microbiome community, metagenome, and metatranscriptome, etc.
  • Building the world-class Korean gut microbiome resource bank based on metagenome analysis
    • Development of isolation technology of major gut microbes including obligate anaerobic microbes
    • Development of culture technology of obligate anaerobic microbes and standardization of culture protocol
    • Establishment of optimized preservation technology for each microbiome resource characteristic
  • Establishment of an integrated DB and operation of KGMB
    • Establishment of Korean gut microbiome resource DB suitable for international standards (KGMB Infranet)
    • Support for the use of microbiome resources via an integrated DB linked to metagenome, multi-omics, and microbiome resources
  • Support for gut microbiome research and commercialization
    • Activating research by supporting multi-omics analysis of useful gut microbes
    • Support for clinical use and industrialization through development of technology of isolation and cultivation of gut microbes and distribution of resources
    • Development and support of technology of isolation and cultivation of gut microbes for clinical use and industrialization
    • Workshop for cultivation and preservation of obligate anaerobic microbes
    • Support of technology transfer of microbiome resources and related technologies